小野妹渣
高通量测序时,在芯片上的每个反应,会读出一条序列,是比较短的,叫read,它们是读序；就是我们测序产生的短读序列，通常一代和三代的reads读长在几千到几万bp之间，二代的相对较短，平均是几十到几百bp。PE reads 就是 paired-end reads。在测序过程中，一条DNA分子的两端都可以测序。先测其中的一端，获得一个reads，然后再转到另一端测序，获得另外一个reads。得到的这两个reads就是PE reads。PE reads 的获得有助于后期序列组装。 有很多reads通过片段重叠,能够组装成一个更大的片段,称为contig，它们是（片段）重叠群；就是不同reads之间的overlap（交叠区），拼接成的序列就是contig。 Contig N50：Reads拼接后会获得一些不同长度的Contigs.将所有的Contig长度相加,能获得一个Contig总长度.然后将所有的Contigs按照从长到短进行排序,如获得Contig 1,Contig 2,contig 3...………Contig 25.将Contig按照这个顺序依次相加,当相加的长度达到Contig总长度的一半时,最后一个加上的Contig长度即为Contig N50.举例：Contig 1+Contig 2+ Contig 3 +Contig 4=Contig总长度*1/2时,Contig 4的长度即为Contig N50.ContigN50可以作为基因组拼接的结果好坏的一个判断标准。 多个contigs通过片段重叠,组成一个更长的scaffold，中文中有脚手架的含义；是比contig还要长的序列，获得contig之后还需要构建paired-end或者mate-pair库，从而获得一定片段的两端序列，这些序列可以确定contig的顺序关系和位置关系，最后contig按照一定顺序和方向组成scaffold，其中形成scaffold过程中还需要填补contig之间的空缺。基因组de novo测序，通过reads拼接获得Contigs后，往往还需要构建454 Paired-end库或Illumina Mate-pair库，以获得一定大小片段（如3Kb、6Kb、10Kb、20Kb）两端的序列。基于这些序列，可以确定一些Contig之间的顺序关系，这些先后顺序已知的Contigs组成Scaffold。 Scaffold N50：Scaffold N50与Contig N50的定义类似.Contigs拼接组装获得一些不同长度的Scaffolds.将所有的Scaffold长度相加,能获得一个Scaffold总长度.然后将所有的Scaffolds按照从长到短进行排序,如获得Scaffold 1,Scaffold 2,Scaffold 3...………Scaffold 25.将Scaffold按照这个顺序依次相加,当相加的长度达到Scaffold总长度的一半时,最后一个加上的Scaffold长度即为Scaffold N50.举例：Scaffold 1+Scaffold 2+ Scaffold3 +Scaffold 4 +Scaffold 5=Scaffold总长度*1/2时,Scaffold 5的长度即为Scaffold N50.Scaffold N50可以作为基因组拼接的结果好坏的一个判断标准. 一个contig被组成出来之后,鉴定发现它是编码蛋白质的基因,就叫singleton； 多个contigs组装成scaffold之后,鉴定发现它编码蛋白质的基因,叫unigene.
奕彩彩绘
序列号的英文是serial number，缩写是S/N。
释义：序号，序列号，轴号
1、Each name had a serial number and linked to background files.
每一个名字对应一个序列号和相关的背景资料。
2、This displays the corresponding machine type, model number, and serial number.
这显示相应的机器类型、型号和序列号。
3、Automatic serial number scanning and software information detection greatly reduces cumbersome data entry.
序号自动扫描和软件信息检测极大地降低了繁琐的数据输入。
4、Matched the serial number to her medical records.
和她病历档案的序号吻合。
5、A user ID and serial number will be sent to your mailbox.
用户ID和序列号将发送到您的邮箱。
优质英语培训问答知识库
