小小爱小吃
1. Direct Reprogramming of Fibroblasts into Functional Cardiomyocytes by Defined FactorsMasaki Ieda, Ji-Dong Fu, Paul Delgado-Olguin, Vasanth Vedantham, Yohei Hayashi, Benoit G. Bruneau, Deepak Srivastava 8月6日，美国和日本的研究人员在《细胞》（Cell）杂志网络版上发表论文称，他们通过在成纤维原细胞中植入特定的Gata4, Mef2c和Tbx5种基因，成功培育出心肌细胞。研究人员发现，在小鼠胚胎的心脏中，有3种基因是生成心肌细胞必不可少的。通过向纤维原细胞中植入这3种基因，可以获得驱动心跳的心肌细胞。与利用诱导多功能干细胞(iPS细胞)培育心肌细胞相比，这种方法更加安全、简捷。该项研究负责人家田真树说：“今后将确认是否可以用同样方法制造出人类心肌细胞。如果可行，心肌梗塞患者将无需接受开胸手术，而只需通过导入这些基因，让那里的纤维原细胞直接生成健康的心肌细胞。” 2. Generation of Rat Pancreas in Mouse by Interspecific Blastocyst Injection of Pluripotent Stem CellsToshihiro Kobayashi, Tomoyuki Yamaguchi, Sanae Hamanaka, Megumi Kato-Itoh, Yuji Yamazaki, Makoto Ibata, Hideyuki Sato, Youn-Su Lee, Jo-ichi Usui, A.S. Knisely et al. 9月3日最新出版的Cell头条是Interspecies Organogenesis，来自日本东京大学医学研究院的研究人员成功的利用大鼠的iPS细胞（诱导多能性干细胞）培育出小鼠的胰腺，这是首次成功的将不同种动物的细胞生成内脏器官的实验。领导这一研究的是东京大学知名干细胞研究专家Hiromitsu Nakauchi，同期Cell杂志也配发了新加坡医学生物学研究院Davor Solter的评论文章。再生医学的目的是希望能从病患的多能干细胞中获得器官，最新的这篇文章通过将大鼠的iPS细胞注入到小鼠胚球中，在缺乏胰腺的小鼠中产生了一个具有功能的大鼠胰腺，这为再生医疗治疗糖尿病开辟了一条新路。一般的情况下，动物的受精卵经过反复的细胞分裂生成生物体的各个内脏器官，而研究人员却改变了这一过程：他们令已被改变遗传基因的雌、雄小鼠进行交配，得到无法自主生成胰脏的小鼠受精卵。三天后，他们又将从大鼠的尾巴中提取的10至15个iPS细胞注入已经分裂成胚胎的小鼠受精卵中，最终培育出一只拥有大鼠胰脏的小鼠。 研究人员进行了大约150只小鼠实验，但只得到了一只成年小鼠。研究结果表明这只小鼠拥有与大鼠相同的胰脏细胞，血糖值也保持正常。目前使用诱导多功能干细胞开展的再生医疗研究主要集中在对脏器和组织的修复上，虽然通过这种干细胞在体内培育器官的研究尚处起步阶段，但相关研究成果为再生医疗领域的研究带来了新希望。 小鼠(mouse)与大鼠(rat)虽在生物分类学上同属脊椎动物门、哺乳动物纲、啮齿目、鼠科，但前者为鼷鼠属、小家鼠种，后者则为家鼠属、褐家鼠种。两者均被广泛运用于遗传学研究中。3. A Large Intergenic Noncoding RNA Induced by p53 Mediates Global Gene Repression in the p53 ResponseMaite Huarte, Mitchell Guttman, David Feldser, Manuel Garber, Magdalena J. Koziol, Daniela Kenzelmann-Broz, Ahmad M. Khalil, Or Zuk, Ido Amit, Michal Rabani et al.来自哈佛大学医学院，麻省理工，斯坦福大学等处的研究人员发现了一类受p53调控的新型长链非编码RNAs（large intergenic noncoding RNAs，lincRNAs），这无论是对于p53这一明星基因的研究，还是长链非编码RNAs的分析都提供了重要的信息。这一研究成果公布在Cell杂志封面上。领导这一研究的是著名的青年科学家John Rinn，John Rinn博士致力于RNA的研究，2009年被评为美国国内撼动科学界的青年英才。这位科学界的成长颇为曲折：滑板和滑雪曾占据了他的所有，直至在美国明尼苏达大学就读期间，他才开始把自己沉浸在生物课堂里并且逐渐意识到他不仅在科学方面有天赋，而且实际上他还非常喜欢科学。John Rinn博士发现了成千上万种的新的形式的RNA，而这些RNA被称作大量插入的非编码RNA或者LINCs，后来证明，这些新发现的RNA在调节基因上面扮演的绝不仅仅是一个辅助的角色，或者更像是直接在导演着整部戏。在最新的这篇文章中，John Rinn博士研究组与其它同事一道发现了一类受p53调控的新型长链非编码RNAs，所谓长链非编码RNAs是一类转录本长度超过200nt的RNA分子，它们并不编码蛋白，而是以RNA的形式在多种层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平。4. Reversal of Cancer Cachexia and Muscle Wasting by ActRIIB Antagonism Leads to Prolonged SurvivalXiaolan Zhou, Jin Lin Wang, John Lu, Yanping Song, Keith S. Kwak, Qingsheng Jiao, Robert Rosenfeld, Qing Chen, Thomas Boone, W. Scott Simonet et al.研究者在小鼠中发现一种分子可以完全逆转晚期癌症伴随的破坏性肌肉丧失，延长癌症动物的生存期。这个分子可以作为诱饵阻断一种关键的肌肉生成抑制蛋白myostatin的活性。Myostatin与诱饵分子结合被“清除”，因而不能与它的正常受体结合启动肌肉退化。癌症肌肉破坏性丧失又称为恶病质，是30%癌症患者的死亡原因。目前尚不清楚癌症是如何导致恶病质，而恶病质如何导致患者机能减退的。科学家认为是通过一连串相关的分子信号引起的。“它以负向方式控制肌肉质量。”该研究的发起者H. Q. Han说道。Han和他的研究团队希望能找到与癌症恶病质有关的信号途径，并阻断它从而达到治疗患者的目的。研究证实阻断myostatin信号途径可以促进肌肉生长。还有一些研究证实与myostatin密切相关的activin A在某些癌症患者中高表达。“我们随机选取了大量体外培养的癌细胞系，发现其中的1/3的细胞系分泌大量的activin A，”Han说：“这使得我们相信在癌症中过量表达的activin A一定有某种系统功能。”研究者们制造出了一种被认为可以影响myostatin和activin A信号途径的可溶性的类activin A受体分子——即一种具有activin受体特性的抗体，这种诱饵分子通过清除配体，阻断受体激活。单独注射这种可溶性分子进入正常的小鼠肌肉可在一周或两周内促进肌肉积聚。当它被给予移植了结肠癌细胞的小鼠时，它的肌肉质量恢复了正常虽然肿瘤仍旧在继续生长。令人感到惊奇的是，没有接受可溶性分子治疗的动物在癌细胞植入后40天内全部死亡，而在同样的时间内处理组动物仍有一半存活。该研究论文发表在Cell杂志上。Han的研究小组并不是第一次尝试通过myostatin信号途径治疗肌肉萎缩。马里兰州巴尔的摩市约翰霍金斯大学的分子生物学家Se-Jin Lee在1997年发现了myostatin基因并确定了它调控骨骼肌的功能。Lee说；“确实存在大量的数据证实靶向这条信号途径是有利的。但事实上扰乱myostatin信号途径引起有力的肌肉再生长并不让人惊喜，因为其他研究证实这条信号途径对肌肉生长有着极端的副作用。”5. GPR120 Is an Omega-3 Fatty Acid Receptor Mediating Potent Anti-inflammatory and Insulin-Sensitizing EffectsDa Young Oh, Saswata Talukdar, Eun Ju Bae, Takeshi Imamura, Hidetaka Morinaga, WuQiang Fan, Pingping Li, Wendell J. Lu, Steven M. Watkins, Jerrold M. Olefsky 6. An Alternative Splicing Network Links Cell-Cycle Control to ApoptosisMichael J. Moore, Qingqing Wang, Caleb J. Kennedy, Pamela A. Silver 7. Dendritic Function of Tau Mediates Amyloid-β Toxicity in Alzheimer's Disease Mouse ModelsLars M. Ittner, Yazi D. Ke, Fabien Delerue, Mian Bi, Amadeus Gladbach, Janet van Eersel, Heidrun Wölfing, Billy C. Chieng, MacDonald J. Christie, Ian A. Napier et al.8. The Language of Histone CrosstalkJung-Shin Lee, Edwin Smith, Ali Shilatifard 9. Activation of Specific Apoptotic Caspases with an Engineered Small-Molecule-Activated ProteaseDaniel C. Gray, Sami Mahrus, James A. Wells 10. Immunoproteasomes Preserve Protein Homeostasis upon Interferon-Induced Oxidative StressUlrike Seifert, Lukasz P. Bialy, Frédéric Ebstein, Dawadschargal Bech-Otschir, Antje Voigt, Friederike Schröter, Timour Prozorovski, Nicole Lange, Janos Steffen, Melanie Rieger et al.一共10篇，望采纳
夏日风清凉
前段时间在一个学术交流群里看到有人提问Microbiome和Microbiota以及Metagenome之间的区别，回想了一下，Ken在上分子植物病理学的时候提了一嘴，当时听懂了，打算给人家解释一下，但话到嘴边又不知道该怎么说。
在网上搜了一下找到了一篇很棒的英文科普文章，作者是Leanne Edermaniger，尽管作者是以肠道微生物为例，但也很好的解释了biome和biota的区别，用于病理学大差不差。
我对原文进行了修改（删减和补充）和翻译，让建团师兄帮忙修正以后发了出来，提供给大家学习参考。
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动物、植物，甚至海洋和土壤都有自己的由特定居民组成的生物群落。
我们的身体不仅仅是我们自己的，还是大量微生物的家园。如果你让多数人来定义微生物组（microbiome），其中少数可能会说它指的是生活在特定地方的细菌生态系统，甚至可能提到肠道。
对于科学家来说，生物群落是一个由动植物群组成的生态系统。他们使用“微”这个词来表示这个生态系统是人眼看不见的。它主要由细菌，但也包括病毒、古细菌和真菌组成（还包括原生动物、卵菌等），在维持环境稳定方面发挥作用 。
人类微生物组（human microbiome）包含数以万亿计的微生物，这些微生物可以根据它们的位置分成多个小部分。当我们说肠道微生物组（gut microbiome）时，我们指的是存在于结肠中的微生物（及其基因）。
但微生物组不仅仅是人类的一个特征——动物、植物、土壤和海洋也有自己的特征。不管你怎么看待它 ，肠道微生物组都对人类健康起着重要作用。
（肠道微生物组）它是数万亿微生物细胞的家园，是我们生物学的重要组成部分，发挥许多生理功能，帮助保持肠道内壁的完整性，并保护我们免受疾病的侵害。
尽管这两个术语可以交换使用，但微生物组（microbiome）和微生物群（microbiota）之间还是存在细微的差别。
在许多情况下，比如在本文章下，微生物组（microbiome）和微生物群（microbiota）通 常是同义词，但认为它们是独立的实体是情有可原的。
简单来说，对于研究人员，存在一些微小但相关的差异，正如营养学家和临床神经科学家 Miguel Toribio-Mateas 解释的那样：“虽然它们经常交换使用，但微生物群（microbiota）是真正的病菌，而微生物组（microbiome）是病菌及其基因。”
相比之下，肠道微生物群描述了大肠中存在的不同的微生物群，包括细菌、古细菌和病毒。它与人类一起进化到今天，彼此受益。
肠道微生物群中存在多种类型的细菌。然而，虽然之前估计人体中的细菌数量是人类细胞的10倍，但现在认为两者的数量大致相同。
一些细菌是有益的，因为它们为健康提供了必不可少的功能，例如生产维生素或丁酸盐。当其他的菌具有多种重要功能时会被认为是益生菌，如双歧杆菌和乳杆菌。
我们也有少量的机会主义微生物，如果它们不受其他微生物群的控制，它们就有能力让我们生病。最后，还有许多共生微生物，它们是无害的并在生态系统中与生物和谐共处。
生物学中的微生物组（microbiome）的定义是指微生物和其基因（以及环境） ，而微生物群（microbiota）仅指微生物本身。 如果你只想谈论环境中的所有基因，它被称为宏基因组——它也是科学研究中常见的兴趣来源。
换句话说，当我们定义微生物组（microbiome）时，我们指的是微生物和其遗传物质，以及它们如何对（不对）人体健康起作用的。请记住，病原体也会构成你的一些微生物组，而不仅仅是有益或共生的微生物。
肠道微生物群（microbiota）的定义是指在特定环境中按类型发现的微生物，包括细菌、真菌、病毒、原生动物和古细菌，其多样性因人而异。
生物学专家的任务是在生命之树中分配名称和分类单元（等级），因而不同的细菌具有由称为分类学的学科分支确定的特有名称。
例如，益生菌鼠李糖乳杆菌实际上是乳杆菌属，属于厚壁菌门，而厚壁菌门属于细菌（与植物或动物不同）。
不同的细菌生活在身体的不同部位，喜欢不同的食物，并执行不同的功能。口腔中的口腔微生物群，具有许多子类别（腋窝、鼻子、脚等）的皮肤微生物群，以及肠道微生物群——当然还有许多其他微生物群。
肠道中数以万亿计的细菌对我们的健康、新陈代谢甚至对于疾病的预防具有深远的影响。
当我们听到微生物、细菌或病毒这些词时，我们往往会想到一些不好的东西，但并非所有这些微生物都会引起疾病。事实上，我们依靠它们来执行我们可能无法完成的功能。
我们肠道中的细菌有助于分解我们食用的植物纤维，因为我们的身体无法为这项艰巨的任务产生足够的酶。由此，他们将碳水化合物转化为有益的代谢物，如丁酸盐和维生素。
微生物群（microbiota）指真实存在的微生物，而微生物组（microbiome）指微生物及其基因（与环境）。
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参考文献：
除此之外，Leanne Edermaniger还有很多科普文章，可以用来学习英语哦~
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