小S妈是顾大厨
全因死亡（all-cause mortality）是种群研究的一种概念，指一定时期内各种原因导致的总死亡，通俗的理解就是不论任何原因导致的死亡，都算作死亡人数。通常用全因死亡率来衡量某时期人群因病、伤死亡危险大小的因素。
1、死亡率是指用来衡量一部分种群中，一定规模的种群大小、每单位时间的死亡数目（整体或归因于指定因素），是在种群层面上研究的问题。死亡率可以得知一个地区的卫生习惯和医疗品质。通常越先进的国家死亡率越低，越落后的国家死亡率越高。死亡率还可得知一个种群在当地生存状况，死亡率高说明这个物种在当地的天敌、竞争者、传染病等较多，死亡率低说明该地区该种群的天敌、竞争者、传染病等少。
2、广义的死亡率包括全因死亡率、粗死亡率、粗死因别死亡率、分年龄死亡率和分年龄性别死亡率、婴儿死亡率（幼仔死亡率、幼虫死亡率或幼苗死亡率）等。
3、全因死亡率就是“所有死因死亡率”，是指一定时期内各种原因导致的总死亡人数与该人群同期平均人口数之比。分母是某段时间内的人口总数；分子是在该段时间内所有死亡人数，不论任何原因导致的死亡，都算作死亡人数，作为分子。
其公式为：全因死亡率=某人群某年总死亡人数/该人群同年平均人口数*K（K=100% ）
《英国医学杂志》（BMJ）刊发了一项英国的研究结果，该研究覆盖26万余例受试者，中位随访5年期间，2430例受试者死亡，其中496例死于心血管病，1126例死于癌症；共报告3748例癌症和1110例心血管事件。
小黄车、小红车、小蓝车、小绿车，成为时下都市一道靓丽的风景线。随着共享单车的出现，越来越多的上班族选择骑车上下班，至少部分路程骑车。
近期，《英国医学杂志》（BMJ）刊发了一项英国的研究结果，为骑车上下班这种通勤方式提供了强有力的支持证据。
之前已有多项研究证实，与开车或乘坐公交、地铁上下班相比，走路或骑自行车对健康有好处，但并没有区分哪种方式更有优势。
这项英国研究发现，走路仅降低心血管病风险，而骑车则不但能防心血管病，还能预防癌症，降低死亡风险。这一研究结果无疑将为共享单车添注新的信心和力量。研究者指出，目前全世界各地人们的运动量都在减少，一定程度上与上下班活动量减少有关。
他们认为，应鼓励上班族采取主动积极的通勤方式，尤其是骑车上下班，这对于降低全球死亡风险和慢性病负担有重要的意义。他们表示，鼓励骑车的政策将会改善人们的健康，例如增加自行车道、提供自行车租赁和公共自行车，等等。
参考资料来源：百度百科-全因死亡率
参考资料来源：凤凰网-BMJ:完全骑车上班全因死亡降低41% 心血管死亡减
大萌萌Alice
Cox比例风险模型(Cox, 1972)本质上是统计学回归模型，医学研究中常用于调查患者生存时间与一个或多个预测变量之间的关系。
生存分析的步骤：
Kaplan-Meier曲线和log-rank检验是单因素分析。在研究中，只研究一个因素的影响，进而忽略了其他因素的影响。
此外，Kaplan-Meier曲线和log-rank检验只有在预测变量是分类的情况下才有用(例如:治疗A vs治疗B;男性和女性)。对于基因表达、体重或年龄等定量预测指标，它们并不能很好的分析。
这儿要提出一种新的方法，那就是Cox比例风险回归分析，既适用于定量预测变量，也适用于分类变量。
Cox回归模型不仅适用于离散或连续性变量，还可以同时评估多个危险因素对生存时间的影响。
Cox比例风险模型可同时评估多个因子对生存的影响。在特定时间点事件发生的概率就是风险概率（ hazard rate），预测风险概率的因素被称为协变量。
Cox模型用风险函数h(t)表示。简单地说，风险函数可以解释为t时刻的死亡风险，可以用下面方程计算:
exp(bi)称为危险比(HR)。bi>0的风险比，表明随着第i个协变量的值的增加，事件风险增加，因此生存时间缩短。换句话说，风险比大于1表示协变量与事件概率正相关，因此与生存时间负相关。
如果存在两个病人 k 和k’，各自风险函数和风险函数比例如下：
换句话说，如果一个人在最初的某个时间点的死亡风险是另一个人的两倍，那么在以后的所有时间里，死亡风险仍然是另一个人的两倍。
survival 包中 coxph ()可以用于构建Cox比例风险回归模型。
formula: 为以生存对象为响应变量的线性模型。函数Surv()创建生存对象，如:Surv(时间，事件)。
Data: 包含变的数据框。
method: 默认efron， 还有‘breslow’ 和 ‘exact’.
示例
对协变量: age, sex, ph.ecog and wt.loss， 首先进行单变量Cox分析; 然后我们将使用两个变量进行多变量cox分析来探究这些因素是如何共同影响生存的。
## 单变量Cox回归
## 对每个协变量进行单因素cox分析。
上面的结果显示了回归系数、效应量(以风险比表示)和每个变量在总体生存率方面的统计显著性。通过单独的单变量Cox回归来评估每个因素对生存的影响。
现在，我们想要研究这些因素是如何共同影响生存的。为了回答这个问题，我们将进行多元Cox回归分析。由于ph.karno在单变量Cox分析中不显著，将在多变量分析中剔除它。我们将把3个因素(性别、年龄和博士)纳入多元模型。
## 多元回归分析
三种检验中(likelihood, Wald和score)的p值都是显著的，表明模型是显著的。这些检验基于的无效假设是所有beta (β)是0。在上面的例子中，无效假设均被拒绝。
多变量Cox分析中，性别和 ph.ecog是显著的(p < 0.05)。但协变量年龄不显著(p = 0.23，大于0.05)。
## 可视化生存时间的估计分布
用Cox模型对数据进行拟合后，就可以在任何给定时间点对特定风险组的预测生存概率进行可视化。函数survfit()估计生存概率，默认情况下是协变量的平均值。
想要评估性别对估计生存概率的影响。在本例中，构造了一个有两行的新数据，每一行代表一个性别值;其他协变量设置为它们的平均值(如果是连续变量)或最低水平(如果是离散变量)。对于一个 虚拟变量（dummy covariate），平均值是数据集中编码为1的比例。
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灵魂尽头z
很多以降TG为目标的治疗手段并未带来显著的心血管获益，相比LDL-C，降低TG水平并取得临床获益需要花十倍以上的努力，许多与之相关的临床试验都以失败告终。 值得庆幸的是，REDUCE-IT研究证实，在他汀类药物调节血脂基础上，IPE可以继续显著降低心血管事件残余风险。这一成果让持续优化血脂管理，进一步降低心血管疾病风险成为可能。目前获得美国食品与药物管理局（FDA）批准上市的IPE成分与既往常见的鱼油补充剂以及含有二十碳五烯酸（EPA）和二十二碳六烯酸（DHA）的脂肪酸药物在成分、含量有很大不同，在心血管风险防控方面的效果也不相同。 该药物是采用专利技术生产的高纯度（≥96%）EPA单分子处方药，是高浓度的单一成分，与市场上其他鱼油制剂和膳食补充剂有根本性区别。而EPA具有减少炎症及胆固醇结晶形成、改善内皮功能障碍和各种含载脂蛋白B（ApoB）脂蛋白颗粒的氧化修饰标志物水平、升高高密度脂蛋白等作用，可通过多种机制抑制心血管疾病发生发展，从而减少心血管事件。来自REDUCE-IT研究的最新结果再一次证明了，EPA水平决定鱼油制剂的心血管获益。对REDUCE-IT研究期间EPA水平与终点事件相关性的分析提示，治疗期间血清EPA水平与主要和关键次要复合终点、心血管死亡风险、总死亡风险等均具有显著相关性（P均＜0.001，图3）。图3EPA水平与主要和关键次要复合终点、心血管死亡风险、总死亡风险等相关除以上终点外，研究还显示，EPA水平同样与心肌梗死、卒中、冠状动脉血运重建、不稳定性心绞痛、心源性猝死、心脏骤停、需要住院的新发心衰等不同事件风险相关（图4、5）。图4 EPA水平与心肌梗死、卒中、冠状动脉血运重建、不稳定型心绞痛等事件风险相关图5 EPA水平与心源性猝死、心脏骤停、需要住院的新发心力衰竭等事件风险相关在已确诊心血管疾病或伴有危险因素的糖尿病患者（一级及二级预防人群）中，EPA同样也与主要复合终点具有相关性（图6）。由此可见，血清EPA水平是REDUCE-IT研究获取阳性结果的很重要的因素。图6 在一级和二级预防人群中，EPA水平与主要终点显著相关对三项结果不同的ω-3脂肪酸相关研究（STRENGTH、JELIS、REDUCE-IT）进行分析可以发现，三项研究受试者基线及治疗后的EPA水平差异较大。既往VITAL研究[3]则提示，同时含有DHA和EPA的ω-3脂肪酸未降低重大心血管事件的发生率。ASCEND研究[4]证实，ω-3脂肪酸未降低糖尿病不伴心血管疾病患者的心血管事件。以上研究结果的差异可能与EPA浓度的差异、治疗期间EPA浓度变化等因素有关，EPA水平升高与心血管不良事件风险降低相关，因而应用高浓度EPA治疗、从而改变受试者血清EPA水平的REDUCE-IT研究[2]获得了阳性结果。基于以上结果，IPE目前被FDA批准用于高危心血管患者，以在降低胆固醇之外降低心血管事件风险。目前获得美国食品与药物管理局（FDA）批准上市的IPE成分与既往常见的鱼油补充剂以及含有二十碳五烯酸（EPA）和二十二碳六烯酸（DHA）的脂肪酸药物在成分、含量有很大不同，在心血管风险防控方面的效果也不相同。 该药物是采用专利技术生产的高纯度（≥96%）EPA单分子处方药，是高浓度的单一成分，与市场上其他鱼油制剂和膳食补充剂有根本性区别。而EPA具有减少炎症及胆固醇结晶形成、改善内皮功能障碍和各种含载脂蛋白B（ApoB）脂蛋白颗粒的氧化修饰标志物水平、升高高密度脂蛋白等作用，可通过多种机制抑制心血管疾病发生发展，从而减少心血管事件。来自REDUCE-IT研究的最新结果再一次证明了，EPA水平决定鱼油制剂的心血管获益。对REDUCE-IT研究期间EPA水平与终点事件相关性的分析提示，治疗期间血清EPA水平与主要和关键次要复合终点、心血管死亡风险、总死亡风险等均具有显著相关性（P均＜0.001，图3）。图3EPA水平与主要和关键次要复合终点、心血管死亡风险、总死亡风险等相关除以上终点外，研究还显示，EPA水平同样与心肌梗死、卒中、冠状动脉血运重建、不稳定性心绞痛、心源性猝死、心脏骤停、需要住院的新发心衰等不同事件风险相关。EPA水平与心肌梗死、卒中、冠状动脉血运重建、不稳定型心绞痛等事件风险相关
