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肯定式函证和否定式函证。肯定式函证就是向债务人发出询证函，要求其证实所函证的欠款是否正确，无论对错都要求复函；否定式函证，它是向债务人发出询证函。但所函证的款项相符时不必复函，只有不符时才要求债务人复函。这两种方式各有优缺点，前者所获取的审计证据较为可靠，但审计成本较高；后者因不可知因素的存在，所获取的审计证据较前者来说不可靠，但成本相对较低。这里值得注意的是，对于重要的应收账项不应以审计成本的高低作为减少审计程序的理由。具体采用哪种方式应根据不同情况做出选择：当个别账户欠款金额较大，或有理由相信欠款可能会存在争议、差错等问题时采用肯定式函证。当符合以下所有条件时，可采用否定式函证：相关的内部控制是有效的；预计差错率较低；欠款余额小的债务人数量很多；有理由确信大多数被函证者能认真对待询证函，并对不正确的情况予以反馈。这里应注意，上述函证方式的选择并不是绝对的，有时候两种方式结合起来使用，将其优缺点互补，可能会更适宜，例如，按照重要性原则，对于大余额账项采用肯定式函证，对于小余额账项则采用否定式函证。
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肯定式函证又称积极式函证。它要求被函证的有关方面不论有关函证余额正确与否、事项是否存在，都需直接回函给注册会计师，对函证事项和金额予以说明。
否定式函证也称消极式函证。如果采用这种函证方式，注册会计师只要求被询证者在不同意询证函列示信息的情况下才予以回函。主要适用于固有风险和控制风险评估为低水平；涉及大量较小的账户余额；预期不存在大量的错误；没有理由相信被询证者不认真对待函证。
函证方式的选择：
当债务人符合下列情况时，采用肯定式函证较好：
1、个别账户的欠款金额较大。
2、有理由相信欠款会存在争议、差错等问题。
当债务人符合以下所有条件时，可以采用否定式函证：
1、相关内部控制是有效的。
2、预计差错率较低。
3、欠款金额小的债务人数量很多。
4、注册会计师有理由确信大多数被函证者能认真对待询证函，并对不正确的情况予以反馈。
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