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1、对被审计公司进行初步调查，发放问卷，主要是内部控制问卷。2、设计内控审计方案，发内控审计通知书3、到被审计单位，与被审计单位管理者沟通4、开展现场审计，主要是制度的审阅进行设计有效性的审批，另外通过串行测试以及实质性测试来验证控制有效性5、小组沟通审计发现，召开离席会议与被审计单位主管沟通问题。6、发正式的审计报告，被审计部门回复整改情况7、进行后续追踪审计

1、制定内控审计计划，内审计划包括：审计范围、人员、时间、审计的流程是那些、需要哪个部门配合。2、形成审计小组，分配审计任务，制定每个流程的内部控制审计方案。3、下发审计通知。4、审计开始。5、提出审计发现，小组讨论。6、形成审计报告。报送批准。7、分发经过批准的审计报告。8、有问题的跟踪问题整改情况，并进行验证。9、回访。

注册会计师考虑和利用内部审计工作结果《企业内部控制审计指引》计划审计工作。

（一）总体要求

审计指引第六条指出，注册会计师应当恰当地计划内部控制审计工作，配备具有专业胜任能力的项目组，并对助理人员进行适当督导。

整合审计中项目组人员的配备比较关键。在计划审计工作时，项目合伙人需要统筹考虑审计工作，挑选相关领域的人员组成项目组，同时对项目组成员进行培训和督导，以合理安排审计工作。

在计划整合审计工作时，注册会计师需要评价下列事项对财务报表和内部控制是否有重要影响，以及有重要影响的事项将如何影响审计工作：

1、与企业相关的风险，包括在评价是否接受与保持客户和业务时，注册会计师了解的与企业相关的风险情况以及在执行其他业务时了解的情况；

2、相关法律法规和行业概况；

3、企业组织结构、经营特点和资本结构等相关重要事项；

4、企业内部控制最近发生变化的程度；

5、与企业沟通过的内部控制缺陷；

6、要性、风险等与确定内部控制重大缺陷相关的因素；

7、对内部控制有效性的初步判断；

8、可获取的、与内部控制有效性相关的证据的类型和范围。

此外，注册会计师还需要关注与评价财务报表发生重大错报的可能性和内部控制有效性相关的公开信息，以及企业经营活动的相对复杂程度。