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补开发票，会计分录：（1）根据补开的发票入账借：应收账款贷：主营业务收入贷：应交税金--增值税（2）如果单位计提了坏账准备，应收账款处理分录：借：坏账准备贷：应收账款（3）如果单位没有计提坏账准备，应收账款处理分录：借：管理费用--坏账损失贷：应收账款根据国税发[2006]156号《关于修订增值税专用发票使用规定的通知》中所做有如下规定: 1、一般纳税人丢失了已开具的专用发票的发票联和抵扣票联的，如果在丢失前已认证相符的则购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件及销售方所在地主管国税局出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》,经购买方主管国税局审核同意的可作为增值税进项税额的抵扣凭证。2、如果丢失前未认证的，购买方凭销售方提供的相应专用发票的记账联复印件到主管国税局进行认证，认证相符的凭该专用发票记账联复印件及销售方所在地主管国税局出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》经购买方所在地的国税局审核同意后可做为增值税进项税额的抵扣凭证。 3、如果一般纳税人丢失了已开具的专用发票的抵扣联的如果在丢失前已认证的，则可使用专用发票的发联复印件留存备查，如果丢失前并未认证的，可使用专用发票发票联到主管税务机关认证，专用发票联复印件留存备查。4、如果一般纳税人丢失了已开具的专用发票的发票联的，可以将专用发票的抵扣联做为记账凭证，专用发票抵扣联复印件留存备查。
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补开发票的方式：1、当事人应当于发现丢失当日书面报告税务机关；2、登报声明作废；3、税局处理后一般就会开具罚单或行政处罚意见书。复印存根，并提交复印件即可。【法律依据】《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第二条在全国范围内统一式样的发票，由国家税务总局确定。在省、自治区、直辖市范围内统一式样的发票，由省、自治区、直辖市税务局（以下简称省税务局）确定。第三十一条使用发票的单位和个人应当妥善保管发票。发生发票丢失情形时，应当于发现丢失当日书面报告税务机关。第二十七条开具发票后，如发生销货退回需开红字发票的，必须收回原发票并注明“作废”字样或取得对方有效证明。开具发票后，如发生销售折让的，必须在收回原发票并注明“作废”字样后重新开具销售发票或取得对方有效证明后开具红字发票。
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