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一、物流公司主要科目是因为根据他的业务而设置的:通常包括以下科目:库存现金、银行存款、其他应收款、其他应付款、主营业务收入、主营业务成本、营业费用、本年利润、实收资本。二、物流公司的帐务相对而言还是比较简单的，主要是成本核算，其成本主要有： 1、油。2、维修。3、车辆应交的各种税费、保险等。 4、人员工资等 。5、运输途中的费用 。三、针对物流企业流程，将有关会计分录整理如下：实收资本的核算 借：银行存款 固定资产 无形资产 贷：实收资本----各股东；主营业务收入的核算，设置一下明细科目：运输收入、装卸收入、堆存收、代理业务收。
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物流公司的会计账务处理如下：
1、收到运输费用时：
借：库存现金,银行存款,应收账款
贷：主营业收入
2、支付运输费时：
借：营业费用-运杂费(燃料费)
贷：库存现金
3、计提各项税费：
借：营业税金及附加-营业税、城建税、教育费附加、地方教育费附加
管理费用-印花税
所得税费用-所得税
贷：应缴税费
4、包车如果是与提供物流劳务服务有关,那就计入销售费用。
5、 如果不是的话,计入管理费用,明细科目可以参考设置为业务招待费,差旅费等。
物流公司中支付包车费的(运货物用)会计分录：
借：主营业务成本
贷：库存现金或银行存款
物流公司中支付包车费的(上下班用)会计分录：
借：管理费用--交通费
贷：库存现金或银行存款
物流公司中支付包车费的(跑业务用)会计分录：
借：营业费用--交通费
贷：库存现金或银行存款
物流企业会计核算流程：
1、确认收入，做应收账款或现金或银行存款。
2、确认成本，无非就是工资、燃油、过路费之类。
3、联运费用，也是成本的一部分，但是可以在申报税金时抵减主营业务收入。
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物流成本核算是根据企业确定的成本计算对象，采用相适应的成本计算方法，按照规定的成本项目，通过一系列的物流些用汇集与分配，从而计算出各物流环节成本计算对象的实际总成本和单位成本。
通过物流成本计算，可以如实地反映物流经营过程中的实际耗费，同时，也是对各种物流费用实际支出的控制过程。
概念
物流成本核算与应用中存在的问题：物流成本核算的目的不明确。物流成本的会计核算方法不明确。物流成本核算与管理没有超出财务会计的范围。物流成本核算的标准不统一。缺乏懂得物流知识的财务会计与管理会计人员。
物流成本核算是物流会计核算的一项重要工作，面对物流成本核算复杂多变的特点，为了在特定经济环境下进行合理的账务处理，就必须做出必要的假设条件，这种假设也是物流成本核算原则确立的基本前提。
参考资料来源：百度百科-物流成本核算
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