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1、基本要素不同：事业单位会计分为资产、负债、净资产、收入、支出，区别于企业会计要素（六大类）：资产、负债、所有者权益、收入、费用、利润2、经济活动的目的不同：事业单位会计不是为了获取利润或利润等价物，而是为了弥补市场缺陷，提供市场不能或不能有效提供的商品和劳务（公共商品和公共劳务），其收支差额不具有经营成果的性质，只表示收入在使用以后的余存情况，所以不设“利润”要素；支出部分不能象私人产品那样通过产品的出售收回，出资人不要求投资回报和投资回收，其所投入的资金不具有权益的性质，但要按规定用途使用，因此，它没有企业会计中的所有者权益。3、追求的目标不同：事业单位会计追求效率最大化，非利润最大化。收费的目的：提高公共商品的使用效率，解决“搭便车”问题。衡量业绩的标准：政绩，非经济效益。政府作为出资人，其所关心的内容主要表现在两方面，一是所提供的公共品是否能满足社会需要，二是公共部门当年提供公共品后剩下的资产净值是多少。事业单位会计科目一、资产类：现金（企业为库存现金） 银行存款（一样） 应收票据（一样） 应收账款（一样） 预付账款（一样） 其他应收款（一样） 材料（企业为原材料） 产成品 对外投资 固定资产（一样） 无形资产（一样）二、负债类：借入款项 应付票据（一样） 应付账款（一样） 预收账款（一样） 其他应付款（一样） 应缴预算款 应缴财政专户款 应交税金（一样）三、净资产类：事业基金 固定基金 专用基金 事业结余 经营结余 结余分配四、收入类：财政补助收入 上级补助收入 拨入专款 事业收入 经营收入 附属单位缴款 其他收入五、支出类：拨出经费 拨出专款 事业支出 经营支出 专款支出 销售税金 成本费用 上缴上级支出 对附属单位补助 结转自筹基建
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其实就是会计处理原则不同:1、事业会计:收付实现制(以实际收到或支出款项 为计帐依据)。2、企业会计：权责发生制（即是不以实际收到或支出款项为计帐基础，而是以权利和义务是否转移为计帐依据）。例：企业销售产品，无论是否收到现金，只要产品的控制权移交到对方，就视为销售，计算收成，结转成本，交纳税金。而事业单位是以实际收到现金确认销售实现。
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一、会计核算基础不同改革开放以来，我国的预算会计可以采用不同的会计基础。事业单位会计根据单位实际情况，分别采用收付实现制和权责发生制。我国的事业单位在进行专业业务活动及辅助活动之外，还可以开展非独立核算经营活动。因此，事业单位对预算资金的收支进行核算和监督以收入实现制为基础，对经营性收支业务可采用权责发生制。而企业应当以权责发生制为核算基础进行会计确认、计量和报告。二、会计要素构成不同事业单位会计要素分为五大类：即资产、负债、净资产、收入和支出。企业会计要素分为六大类；即资产、负债、所有者权益、收入、费用和利润。二者的资产和负债从他们的本质上基本是相同的，其他几类要素在实质上有较大的区别。1.净资产与所有者权益：事业单位当中的净资产是政府与非盈利组织所拥有的资产净值，产权单一，是预算会计所特有的。企业会计中与之相对的概念是所有者权益，它是各种者对企业净资产的所有权。显然预算会计中的净资产没有上述明确的所有者权益特征，因而在预算会计中采用净资产命名以区别于企业会计的所有者权益命名是很有必要的，也是非常合适的。2.收入：事业单位和企业都有收入要素，名称虽然一致，但在本质上有较大的不同。事业单位的收入指国家或单位依法取得的非偿还性资金，主要从财政部门、上级单位或其他单位取得的收入。事业单位的主要经济来源是通过上级拨款，所以具有非偿还性的特点，他的目的是为了补偿支出，而不是为了盈利；而企业的收入是指企业日常活动中形成的、会导致所有者权益增加的、与所有者投入资本无关的经济利益的总流入，企业收入的实现主要是靠销售产品或提供劳务产生的，其主要目的是为了企业盈利。3.支出与费用：事业单位的支出是指开展业务活动和其他活动所发生的各项资金耗费和损失以及用于基本建设项目的开支。事业单位的支出有着财政资金再分配以及按照预算向所属单位拨出经费的性质，其目的只是为了耗费。而企业的费用是指企业为销售商品、提供劳务等日常活动所发生的经济利益的流出，会导致所有者权益减少的、与向所有者分配利润无关的经济利益的总流出。其目的是为了取得营业收入，获得更多的新资产；只有那些在企业生产经营活动中为取得营业收入而发生的各种支出，才是费用。4.利润：利润是企业特有的，指在一定会计期间的经营成果。而事业单位没有利润这个会计要素，因为它是非盈利组织，不涉及到盈利问题，所以也就没有利润。即使有一定的经营活动，期末也只是结转到“结余”。三、会计等式不同事业单位的会计等式是“资产+支出=负债+净资产+收入”，此等式为动态等式，反映单位在业务营运过程中收支结余情况及净资产的增值情况。因为事业单位的资金来源主要是通过上级拨款取得的，所以要严格监督各项支出的耗费，因此要采用动态等式，资产负债表也是以此等式为依据的。企业的会计等式为“资产=负债+所有者权益”，此等式为净态等式，反映了会计要素之间的数量关系，反映了企业资产的归属关系，表明了企业和所有者是各自独立存在的。同时，也是编制资产负债表的理论依据。四、会计核算内容及方法有其特殊性在预算会计中，有一些核算内容和企业会计有明显的差异，有其特殊性。1.固定：事业单位核算固定资产，需设置“固定资产”和“固定基金”两个账户。固定基金是事业单位固定资产的资金来源，一般由财政或上级主管部门拨款，也可以是其他单位投入或融资租赁。事业单位的支出具有消耗性与不可补偿的特点，所以无需计提折旧。而企业的固定资产在使用过程中不断地磨损，要通过计提折旧的方式逐步转移到产品成本或期间费用中去。2.专用基金：专用基金是事业单位按规定提取或设置的专门用途的资金，包括修购基金、职工福利基金、医疗基金和住基金，各项专用基金都规定专门的用途和适用范围，除财务制度有特殊规定外，一般不得挪用、占用。3.投资基金：事业单位的对外投资一般与投资基金相适应。不仅要设置“对外投资”账户，还要设置“事业基金——投资基金”账户。4.一般不实行成本核算：事业单位一般不实行成本核算，即使有成本核算，也是内部成本核算。以上仅仅是两者不同表现的一部分内容，还有大量细节性差异，不再冗述。随着经济体制改革的不断深化，两类会计的差异将会逐步缩小，但不可能消灭差异。
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