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在各相关应用的会计科目下设（政府补助**项目）二级科目，并记入相关明细分类账即可。财政拨入的专项资金应区分是与资产相关的政府补助，还是与收益相关的政府补助。如果农业企业取得的政府专项资金属于政府无偿资助企业，则应作为政府补助来处理。即与资产相关的政府补助以及用于补偿企业以后期间的相关费用或损失的政府补助，确认为“递延收益”，以后再按相关规定分期计入“营业外收入”科目；如属于专款专用的，则应计入“专项应付款”科目，工程项目完工所形成的长期资产部分，转入“资本公积——资本溢价”科目，未形成长期资产需要核销部分，冲销“在建工程”等科目，需要返还的拨款结余，通过“银行存款”上交。
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扶贫资金核算一般有三种方法：一是通过“公积公益金”科目核算，拨入扶贫资金记该科目的贷方，支出记借方或通过“在建工程”科目核算，然后结转；二是通过“补助收入”科目核算，拨入扶贫资金记贷方，使用资金记入“农业发展支出”、“管理费用”、“经营支出”、“在建工程”等科目的借方（这种方法使用较少）；三是通过“专项应付款”科目核算，拨入款项记入该科目的贷方，项目支出记入本科目借方，工程类支出通过“在建工程”科目，完工结转后将相应的专项应付款余额转入“公积公益金”科目。扶贫资金支出，会计分录借：营业外支出/管理费用/在建工程等贷：银行存款等
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