健康管理师考试为闭卷人机对话考试，考试分为两场，分别为“理论知识”和“操作技能”，两门科目均实行百分制，60分及格。两门科目必须一次考过，单科合格成绩不予保留，考试成绩合格者颁发《国家职业资格证书》，证书在全国范围内有效。健康管理师是2005年10月劳动和社会保障部第四批正式发布的11个新职业之一。2005年12月，劳动和社会保障部425号文件《关于同意将医疗救护员等2个新职业纳入卫生行业特有职业范围的函》将健康管理师列为卫生行业特有职业（工种）归入卫生部进行管理。卫生部职业技能鉴定指导中心负责该职业的职业技能鉴定相关工作，是该职业国家职业资格唯一的认证单位。
